第二代和第三代试管的主要区别在于应用的人群不同，第二代试管婴儿主要是针对于男方的严重少精、弱精、畸精或者无精子症的患者，第三代试管婴主要应用于夫妇有单基因疾病的患者。

第二代试管婴儿主要帮助以下几种患者怀孕，如严重少精子症、弱精子症和畸胎症等，对于需要进行植入前胚胎遗传学检查的患者，具体操作是选择精液。精液优化后，选择外观正常、活力良好的精子，直接加入卵子中，完成整个受精过程。

第三代试管婴儿在胚胎移植前应首先对所有评分良好的胚胎进行胚胎染色体检查，筛选出染色体检查正常的胚胎，然后进行移植。第三代试管婴儿是一种助孕方法，主要用于防止遗传性疾病向下一代传播，以防止患者夫妻一方或双方患家族遗传性疾病。

第二代和第三代试管婴儿各有优势，需在医生的建议下采取最佳的治疗方案。